Все гораздо сложнее.
Мир состоит не из одних аминокислот. Да, аминокислоты - это строительные элементы белков, а биохимические процессы протекают при участии белков (ферменты - это тоже белки). Мы видим свет при помощи белков и ферментов.
Кроме строительного материала нужна энергия, а это жиры и углеводы.
Фермент - это белок, который способен разорвать химическую связь вещества и образовать из его частей новые вещества.
Мало того, что есть разные ферменты - протеазы (которые расщепляют белок), липазы (жир) и карбогидразы (углеводы), есть еще куча разновидностей внутри каждой группы, от которых зависит как именно разобьется вещество (на какие осколки).
Теперь про ферментацию. Каждую клетку можно рассматривать как источник белков, жиров и углеводов. И в ней есть свои ферменты, но их действие управляемо.
Проращивание (замачивание) зерна - это ферментация, при которой из сложных веществ-запасов получаются простые, которые расходуются на развитие ростка. Варка - это тоже ферментация, где под действием температур все процессы ускоряются.
То, что вы сварили бойл - это тоже ферментация.

Давайте сначала про пищеварение. Это попроще. Как вы думаете, как оно осуществляется у карпа? Что он легко усвоит, а что не очень? Небольшой намек - почему одни люди дрищут от цельного молока, а другие нет?